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生物化学与生物分子学硕士点于2003年由学校批准建设，2005年 11月由国家学位办审查通过，2011年按生物学一级学科招生。在研的项目主要来源于国家自然基金，学术上形成了具有地学特色的研究方向，尤其是在生物地球化学、分子古生物学以及地微生物学等领域在国内已形成了学科优势。
目前有教授3名，副教授1名，讲师3名。包括国家杰出青年获得者、学校特聘教授和国外的兼职教授等学科带头人。师资队伍中有7人有国外留学经历，并与有关大学保持着良好的合作。
实验室的大型设备包括GC-MS、 GC- TIR-MS、MAT-251、Biolog微生物鉴定系统、G-Box凝胶成像系统、荧光定量PCR仪、梯度PCR仪、ICP-AES、Benckman高速离心机、Olympus显微镜等。借助古生物学与地层学硕士点和博士点，已培养5名毕业生，分别就业于上海、北京、广州等地的高校、科研院所、科技馆以及在国外继续深造等。
学科的主要研究方向主要有分子生物学和地球微生物学。分子生物学主要包括①分子古生学，特色为应用现代分子生物学的手段，探索生物演化、起源；②现代微生物分子生物学的研究，通过分子生物学手段，检测不同地质环境下出现的微生物类群，并探讨微生物在地质过程中的作用。地球微生物学研究现代地质过程和地质环境下的微生物种类、群落特征以及微生物在各种地质过程中的作用，揭示微生物在生态系统中物质循环和能量流动的重要地位。
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